При сохранении агрегата для выбора операции (INSERT или UPDATE) SDJ по дефолту опирается на значение поля ИДа - если оно дефолтное (null или 0) - делает вставку, иначе - апдейт.
Это ломается если ИДы (UUID-ы) генерируются на клиенте или приложением.
И это можно закостылять добавив поле версии. В этом случае SDJ будет смотреть на его значение и для 0-ой версии делать вставку, а для больших - обновление.
см. также ID Generation и Entity State Detection Strategies.